Nicolas Flamel et les jumeaux continuent leurs aventures . Voilà deux jours que les pouvoirs de Sophie sont réveillés et Josh ressent une profonde jalousie envers sa jumelle. Dee, le néchromancien, décide de se servir de Machiavel, un puissant immortel, pour l'aider à capturer les jumeaux et l'Alchimiste qui lui échappent depuis plus de 700 ans. Perdus dans Paris, Nicolas va retrouver un vieil ami qui va beaucoup l'aider dans sa quête: Trouver quelqu'un pour éveiller les pouvoirs de Josh, qui associés à ceux de sa soeur seront encore plus puissants.