Den gamle Gibsongruven ligger i fjellsiden like bak Perlen pensjonat. Cecilia, Leo, Une og Egon drar for å utforske gruven som ikke har vært i bruk på lang tid. Der finner de spor etter den store gruveulykken, svartkrutt og kasser med gamle dynamittgubber. Langt inne i de mørke gruvegangene gjør de oppdagelser som tyder på at den gamle gruven skjuler hemmeligheter som ikke tåler dagens lys. CLUE-gjengen fatter mistanke om at det som skjer langt inne i fjellet har noe å gjøre med dykkerskipet som ligger i Skutebukta. Skipet er leid inn for å lete etter frakteskipet som i 1868 gikk ned ute ved Steinholmen med en hemmelig last om bord. For å klare å løse mysteriet må CLUE-gjengen gjøre seg kjent med filosofen Platons menneskesyn og velge om de skal stole på fornuften eller følge følelsene.